Tahap berikutnya adalah membandingkan hasil pemeriksaan PMMoV dengan E. coli serta indikator fekal atau patogen lain yang relevan. Perbandingan tersebut diperlukan untuk menilai hubungan antara keberadaan PMMoV dan indikator pencemaran yang sudah digunakan dalam pemantauan kualitas air.
Penelitian juga perlu mempertimbangkan perubahan kondisi lingkungan. Variasi musim, curah hujan, debit sungai, kepadatan penduduk, sistem sanitasi, dan karakteristik sumber limbah dapat memengaruhi pengenceran, perpindahan, serta keberlangsungan materi genetik virus di perairan.
Faktor-faktor tersebut membuat hasil dari satu lokasi atau satu periode pengambilan sampel belum tentu mewakili kondisi wilayah lain. Karena itu, penelitian lokal perlu dirancang untuk menangkap variasi yang relevan dengan karakteristik perairan dan sumber pencemarannya.
Dalam tahap penerapan, RT-qPCR dapat dipertimbangkan untuk laboratorium rujukan atau pemantauan berkala yang membutuhkan data kuantitatif. Sementara itu, PCR konvensional dapat dimanfaatkan pada penelitian awal untuk menguji keberadaan target genetik.
Metode yang lebih sederhana juga berpotensi dikembangkan untuk kebutuhan skrining. Namun, penggunaannya tetap perlu didasarkan pada pembuktian kinerja agar hasilnya sesuai dengan tujuan pemeriksaan.
“Dengan demikian, metode ini sangat mungkin dikembangkan di Indonesia, tetapi penerapannya sebagai sistem pemantauan rutin membutuhkan validasi lokal, prosedur kendali mutu, tenaga terlatih, serta pertimbangan biaya,” ujarnya.
Kebutuhan validasi dan kendali mutu menjadi bagian penting dalam pengembangan metode tersebut. Selain memastikan hasil pemeriksaan dapat ditafsirkan dengan benar, penerapan rutin juga perlu mempertimbangkan kesiapan laboratorium, ketersediaan tenaga terlatih, dan biaya pemeriksaan.
PMMoV dan Virus Manusia sebagai Indikator Pencemaran Fekal
Selain PMMoV, sejumlah virus enterik manusia telah diusulkan sebagai indikator pencemaran fekal. Virus-virus tersebut berasal dari kelompok yang ditularkan melalui jalur fekal-oral, yakni perpindahan agen infeksi melalui kontaminasi yang berkaitan dengan tinja dan masuk melalui mulut.
